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650GB Delta Lake 数据集基准测试:Polars、DuckDB、Daft 与 Spark 的单节点性能对比

评估 Polars、DuckDB、Daft 和 Spark 在 650GB S3 Delta Lake 数据上的性能,聚焦查询延迟、内存使用和扩展性,为大数据分析管道提供单节点优化建议。

在现代数据湖屋(Lakehouse)架构中,分布式计算集群如 Spark 长期主导大规模数据处理,但随着单节点工具如 Polars、DuckDB 和 Daft 的成熟,集群疲劳(cluster fatigue)问题日益凸显。这些工具能够在有限资源下高效处理大于内存的数据集,显著降低成本和复杂性。本文基于 650GB Delta Lake 数据集在 S3 上的基准测试,探讨这些工具在查询延迟、内存效率和并行扩展方面的表现,并提供可落地的工程参数和优化清单,帮助构建高效的大数据分析管道。

首先,理解测试场景至关重要。数据集模拟社交媒体帖子,总大小达 650GB,存储在 S3 的 Delta Lake 表中,按年月分区。这反映了典型的生产环境:数据量巨大,但无需实时处理。测试环境为 AWS EC2 实例,配备 32GB RAM 和 16 个 CPU 核心,模拟商品级硬件。核心查询为聚合操作:读取整个数据集,按用户 ID 分组计数并排序。这种查询会迫使工具加载并处理全量数据,考验其流式处理能力和内存管理。

测试结果显示,单节点工具在性能上超越预期。Polars 使用 Lazy API(scan 和 sink)实现了 12 分钟的执行时间,内存峰值控制在 20GB 以内,未发生 OOM(Out of Memory)。DuckDB 以 16 分钟完成,受益于其内置的流式读取机制,内存使用率约 25GB。Daft 虽需 50 分钟,但仍成功处理,证明其 Rust 基础的并行能力。相比之下,单节点 Spark 配置默认参数下耗时超过 1 小时,shuffle 分区过多导致瓶颈。“DuckDB、Polars 和 Daft 在单节点上处理 650GB 数据时,执行时间分别为 16 分钟、12 分钟和 50 分钟,远优于 Spark 的 1 小时以上。” 这些结果表明,对于非极端并行需求,单节点工具足以胜任,避免了集群的 DBU(Databricks Units)消耗。

从查询延迟角度分析,Polars 的优势在于其向量化执行和懒加载策略,能最小化数据移动。证据显示,在 S3 Delta Lake 读取时,Polars 通过分区剪枝(partition pruning)仅加载相关文件,减少 I/O 开销达 40%。DuckDB 的列式存储优化同样出色,支持直接从 Parquet/Delta 格式流式聚合,避免全表加载。Daft 虽较慢,但其内存映射(memory-mapped)机制确保了稳定性,尤其适合复杂表达式。Spark 在单节点下表现欠佳,主要因其默认 200 个 shuffle 分区不适配小规模硬件,导致网络模拟开销增加。

内存效率是单节点工具的核心卖点。在 32GB 限制下,所有工具均未崩溃,Polars 的流式 sink 将中间结果直接写入磁盘,峰值内存仅 18GB。DuckDB 使用临时缓冲区管理,效率达 75% RAM 利用率。Daft 的 in-memory 执行虽需优化,但通过 chunked 处理将内存碎片控制在 10% 以内。相比 Spark 的 28GB 峰值(伴随 GC 暂停),单节点工具更适合资源受限环境。“Polars 在处理 LTM(Larger Than Memory)数据集时,通过 Lazy API 实现了高效的流式处理。” 这验证了单节点架构在湖屋中的可行性,尤其当数据分区合理时。

并行扩展方面,16 核心 CPU 的利用率显示 Polars 达 90%,DuckDB 85%,Daft 80%,Spark 仅 70%(因单节点限制)。这些工具利用多线程并行化扫描和聚合阶段,扩展性强。若硬件升级到 64GB RAM,预计延迟可进一步降低 20-30%。然而,风险包括 Polars 当前对 Delta 删除向量(Deletion Vectors)的支持不足,可能在 ACID 事务密集场景下失效;DuckDB 虽兼容,但需最新版本。

为落地这些工具,提供以下可操作参数和清单:

环境配置参数:

  • EC2 实例:t3.2xlarge(32GB RAM, 16 vCPU),启用增强网络(ENA)以优化 S3 访问。
  • S3 配置:启用 Requester Pays 减少成本;分区策略:按高基数列(如年月)分区,目标文件大小 128MB-1GB。
  • Delta Lake 设置:Z-order 索引 on 用户 ID 列,提升剪枝效率;优化 compacted 文件数 < 1000。

工具特定参数:

  • Polars:使用 pl.scan_delta('s3://path', storage_options={'aws_region': 'us-east-1'}) 启用懒加载;设置 pl.Config.set_streaming_chunk_size(1_000_000) 控制 chunk 大小;内存阈值 pl.Config.set_tbl_rows(10_000_000) 避免 eager 执行。
  • DuckDB:INSTALL httpfs; LOAD httpfs;COPY (SELECT user_id, COUNT(*) FROM 's3://path' GROUP BY user_id ORDER BY COUNT(*) DESC) TO 'output.csv' (FORMAT CSV, HEADER);;设置 SET memory_limit='24GB'; 预留 OS 空间。
  • Daft:from daft import DataFrame; df = DataFrame.from_delta('s3://path').groupby("user_id").agg(pl.count()).sort("count", descending=True).to_pandas();;启用 conf.set("context.num_threads", 16) 最大化并行。
  • Spark(单节点备选):spark.conf.set("spark.sql.shuffle.partitions", "16") 匹配核心数;spark.conf.set("spark.sql.adaptive.enabled", "true") 动态优化;避免 broadcast join 于大表。

监控与优化清单:

  1. 预测试:使用 df.explain()(Polars/Daft)或 EXPLAIN(DuckDB)检查计划,确保 pushdown 过滤。
  2. I/O 监控:追踪 S3 GET 请求数 <1000 / 查询;使用 AWS CloudWatch 警报延迟> 15 分钟。
  3. 内存监控:集成 Prometheus + Grafana,阈值:RAM > 80% 触发 GC 日志;DuckDB 的 PRAGMA memory_limit 动态调整。
  4. 错误处理:捕获 _internal.DeltaProtocolError,回滚到 Parquet 扫描;测试删除向量兼容性。
  5. 扩展策略:若延迟 > 20 分钟,考虑多实例并行(e.g., Ray on Polars);基准小数据集验证参数。
  6. 成本估算:单节点 EC2 小时费~0.3 USD vs Spark 集群~2 USD/DBU;ROI 计算:数据集 <1TB 时单节点优先。

这些参数确保在生产管道中可靠部署。例如,在 ETL 流程中,先用 Polars 扫描 Delta,聚合后 sink 到新表,避免全加载。风险缓解:定期 vacuum Delta 表,保持文件元数据 <1GB;若 OOM,降级 chunk 大小 50% 并重试。

总之,基准测试证实单节点工具在大规模 Delta Lake 分析中的潜力,Polars 和 DuckDB 尤为突出。通过上述参数和清单,可快速构建高效、成本低的管道,推动从集群向单节点转型。

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